1 – Avaliar o perfil mutacional de predisposição e prognóstico em pacientes com câncer de mama, próstata, pulmão e colorretal na população brasileira para auxiliar na decisão da estratégia preventiva e terapêutica.
2 – Avaliar o perfil transcriptômico para identificação de padrões moleculares vinculados com perfis mutacionais distintos e associados com predisposição e prognóstico em pacientes com câncer de mama, próstata, pulmão e colorretal na população brasileira para auxiliar na decisão da estratégia preventiva e terapêutica.
3 – Realizar sequenciamento genômico espacial para correlacionar padrão de alteração genômica com padrão tecidual de desenvolvimento tumoral, nos mesmos tumores; avaliação do perfil imunológico do microambiente e correlação com alteração.
4 – Criar um modelo multiômico integrando dados genômicos e transcriptômicos para identificação de padrões moleculares capazes de guiar a terapia oncológica de precisão em pacientes com câncer de mama, próstata, pulmão e colorretal na população brasileira.
5 – Identificação de alterações moleculares e vias de sinalização aberrantes que representem oportunidades para terapias personalizadas em pacientes com hematopoese clonal, síndrome mielodisplásica e leucemia mieloide aguda no contexto de mutações em genes reguladores da epigenética, da maquinaria de splicing de RNA e do reparo de DNA, por meio de aplicação e integração de tecnologias ômicas.
6 – Identificar drogas que tenham como alvo alterações moleculares e vias de sinalização aberrantes associadas com o perfil clínico e mutacional em pacientes com hematopoese clonal, síndrome mielodisplásica e leucemia mieloide aguda, no contexto de mutações em genes reguladores da epigenética, da maquinaria de splice de RNA e do reparo de DNA, por meio de análises de inteligência artificial.
7 – Validação ex vivo e in vivo dos alvos terapêuticos e drogas identificados a partir da análise integrada de dados clínicos e ômicos para tratamento de síndrome mielodisplásica e leucemia mieloide aguda.
8 – Avaliação do perfil de expressão de genes associados ao metabolismo do colesterol em células leucêmicas e no microambiente leucêmico no momento do diagnóstico e nas avaliações da resposta terapêutica em pacientes com leucemia mieloide aguda tratados com quimioterapia convencional.
9 – Avaliação do potencial terapêutico de drogas associadas com a modulação do metabolismo do colesterol em combinação com quimioterapia convencional como estratégia de medicina de precisão em pacientes com leucemia mieloide aguda selecionados.
10 – Validação ex vivo e in vivo dos alvos terapêuticos e drogas moduladoras do metabolismo do colesterol como oportunidades terapêuticas em pacientes com leucemia mieloide aguda resistentes ao tratamento quimioterápico convencional.
11- Cultivar células de pacientes com neoplasia hematológica com característica moleculares específicas e obter linhagens celulares imortalizadas a partir de protocolos de imortalização.
12 – Identificar mecanismos moleculares e fenotípicos que reduzem a capacidade citotóxica das células imunes inatas em modelos murinos e humanos de neoplasias mieloides.
13 – Avaliar o impacto do estado imunológico citotóxico na resposta ao tratamento de neoplasias mieloides
14 -Esclarecer o papel dos ligantes de NK nas células leucêmicas na determinação do
fenótipo de resistência ao tratamento na Leucemia Mieloide Aguda.
15 – Testar reversão do fenótipo T e NK disfuncional com base nos marcadores-alvo identificados pelo transcriptoma/proteoma em modelos de neoplasias mieloides.
16 – Investigar a cinética e prognóstico da doença residual mensurável por meio de citometria de fluxo multiparamétrica e métodos de biologia molecular para pacientes com leucemia mieloide aguda de diferentes categorias de risco genético-molecular.
17 – Desenvolver estratégias de reestratificação do risco de pacientes com LMA com base em resultados da pesquisa de células leucêmicas residuais por métodos de Medicina de Precisão para tomada de decisão terapêutica.
18 – Desenvolver terapia personalizada no câncer baseada em algoritmos clínico-biológicos.
19 – Desenvolver e testar sistemas de nanocarreamento de moléculas em sistemas de nanoemulsão, lipossomais ou de nanopartículas sólidas para entrega de drogas candidatas para terapia personalizada no câncer.
20 – Avaliar a eficácia e segurança do uso do UM171 para expansão de células tronco hematopoéticas derivadas de pacientes com falência medular: anemia aplástica autoimune, anemia aplástica hereditária (telomeropatias) e anemia aplástica iatrogênica. O estudo será desenvolvido a partir da coorte de falências medulares do HC FMRP USP, que representa a maior coorte de pacientes com falências medulares com anotações clínicas e moleculares detalhadas da América do Sul.
21- Desenvolver um protocolo de produção de células CAR-T com manufatura em tempo reduzido (FAST CAR-T), não realizando a fase de expansão celular, o que pode melhorar a qualidade do produto celular obtido e expandir o acesso da população à terapia CAR-T.
22 – Comparar as características do produto de células CAR-T com manufatura em tempo reduzido (FAST CAR-T) com o produto de manufatura de CAR-T em tempo convencional em termos de potencial de células e citotoxicidade em tumores CD19-positivos.
23 – Produção de células CAR-NK para estudos clínicos, por meio do estabelecimento do processo de expansão de células NK em sistema fechado.
24 – Desenvolver novos CARs com alvos específicos para tratamento de tumores sólidos e neoplasias hematológicas, incluindo CARs anti ROR-1, anti-CD107 e CAR biospecifico anti-Her2 e anti-Muc1.
25 – Avaliação do impacto da integração viral em células NK/T utilizando diferentes envelopes virais. Essa análise é fundamental, pois a integração do material genético viral pode alterar a expressão gênica, ativando genes que potencialmente afetam o funcionamento das células-alvo. Compreender esses efeitos é essencial para garantir a segurança e eficácia de terapias baseadas em células geneticamente modificadas.
26 – Capacitar alunos de pós-graduação em pesquisa oncológica avançada, com foco em alvos terapêuticos e terapias personalizadas.
27 – Promover a participação de alunos de pós-graduação em publicações científicas e conferências, desenvolvendo competências para pesquisa translacional e clínica em terapia oncológica de precisão.
28 – Promover a capacitação de pesquisadores por meio de supervisão de pós-doutores na área de pesquisa em terapia oncológica de precisão e terapia avançada.
29 – Publicar artigos científicos de alta qualidade em periódicos especializados, com o intuito de disseminar os resultados das pesquisas realizadas, contribuir para o avanço do conhecimento e aumentar a visibilidade do INCT-TOP no cenário científico.
30 – Estabelecer e formalizar parcerias estratégicas com instituições de pesquisa, hospitais e empresas do setor de saúde, visando promover a troca de conhecimento, o desenvolvimento de projetos colaborativos e o acesso a tecnologias avançadas no tópico de terapia oncológica de precisão.
31- Divulgação científica acessível e atualizada para a sociedade, incentivando a compreensão e o engajamento em temas científicos relacionados à terapia oncológica de precisão.
32 – Construir e fortalecer as redes de colaboração entre as Instituições Parceiras Internacionais e as Nacionais.